Universitatea FUNDEPOS este dezvoltată în Costa Rica ca urmare a trei evenimente educaționale istorice din domeniul științelor economice. Primul dintre acestea odată cu sosirea Universității Naționale în 1983, cu sediul în San Diego, California, SUA, care a instituit primul program de masterat profesional în administrarea afacerilor din țară.
Al doilea moment istoric a avut loc în 1993, când acest program a fost transferat, în ceea ce privește administrarea sa, la Universitatea din Costa Rica (UCR). În acest scop, a fost creată Fundația pentru Studii Postuniversitare și Cercetare în Științe Economice (FUNDEPOS).